基于SSR标记的黔南茶树种质资源DNA指纹图谱构建
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贵州省普通高校教育质量提升重点科研项目(2011017);黔南民族师范学院项目(QNSY2010014)


Establishiment of DNA Fingerprinting for Tea Germplasm from Qiannan Prefecture by SSR Markers
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    摘要:

    以黔南60个茶树种质资源为材料,使用15对引物,通过SSR 技术对其进行了DNA 指纹数据库的构建。结果显示,所采用的15对引物共扩增出147个等位基因,有较好的多态性。位点的期望杂合度和多态性信息含量的变化范围分别为0.128~0.939和0.124~0.927,平均值分别为0.602和0.572,综合各项指标筛选出6对引物QNSSR01、QNSSR02、QNSSR04、QNSSR06、QNSSR18、QNSSR23上的23个等位基因用于黔南茶树种质资源DNA 指纹图谱构建,60个茶树种质资源的SSR 指纹图谱互不相同,可以作为各品系特定的图谱。

    Abstract:

    Sixty tea germplasm from Qiannan prefecture were collected to construct DNA fingerprint database by SSR technique. The results showed that 147 alleles were detected with considerable polymorphism by 15 pairs of primers employed in the experimental design.The ranges of expected heterozygosities and polymorphism information content at 15 SSR loci of 60 cultivars were 0.128-0.939 and 0.124-0.927 respectively,with an average of 0.602 and 0.572 respectively.And a total of selected 23 alleles from 5 primers (QNSSR01、QNSSR02、QNSSR04、QNSSR06、QNSSR18、QNSSR23) were used for the DNA fingerprint construction. Sixty cultivars with different SSR fingerprints of each other can serve as the cultivars-specific patterns and as an important basis for cultivars identification.

    参考文献
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    引证文献
引用本文

陈世军,张明泽,姚玉仙,等.基于SSR标记的黔南茶树种质资源DNA指纹图谱构建[J].植物遗传资源学报,2017,18(1):106-111.

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  • 收稿日期:2016-02-16
  • 最后修改日期:2016-06-29
  • 录用日期:2016-07-01
  • 在线发布日期: 2017-01-17
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