• 2018年第19卷第5期文章目次
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    • 贵州优异农业生物种质资源

      2018, 19(5):821-829. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180417001

      摘要 (1730) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2233) 评论 (0) 收藏

      摘要:“贵州农业生物资源调查”项目是国家科技基础工作重大专项, 根据项目要求, 现已完成对贵州省42个县(市)的普查和21个(市)的系统调查。本项目历时5年, 经过多个科研院所的共同努力,基本查清了贵州现有的农业生物资源,共采集了4800多份种质资源样本。经过鉴定筛选,从抗病、抗逆、优质、早熟、丰产等不同方面筛选出150多份优异种质资源。这批优异种质资源可为作物育种和基础研究提供更有价值的种质材料, 应加强利用和保护。

    • 云南省夏大豆种质资源表型鉴定和综合评价模型构建

      2018, 19(5):830-845. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180122002

      摘要 (1618) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2567) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】为全面准确评价西南高原夏大豆种质资源,构建大豆种质资源综合评价体系,满足育种家快速、定向选择育种亲本的需求。【方法】本研究采用路径分析、主成分分析、隶属函数、聚类分析、回归分析等多元分析方法相结合,对451份夏大豆种质资源的11个重要表型性状进行研究。【结果】结果表明:各性状间存在丰富的变异和错综复杂的相关性,且性状间相互影响清晰的分为两条路径,一条最终影响因子为大豆品质,另一条最终影响因子为单株粒重。通过主成分分析,将11项相关指标转化为5项独立的综合指标,能代表全部数据81.2%的信息量。通过隶属函数计算综合评价值(D),并对其进行聚类分析,将451个种质划分成3类,筛选出综合表现较好种质97份。通过逐步回归建立大豆种质综合评价数学模型: ,估计精度在95.25%以上。【结论】在451个种质中筛选出97份综合表现较好的种质,并运用11个性状构建种质资源评价数学模型。

    • 六棱大麦种质表型遗传多样性评价

      2018, 19(5):846-856. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180102001

      摘要 (1566) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2239) 评论 (0) 收藏

      摘要:为探究六棱大麦种质资源的遗传多样性,提高六棱大麦育种组合选配的针对性和育种效率。以来自国内外的89份六棱大麦种质为材料,考察了3个不同环境下参试材料的株高、穗下节间长、穗长、主穗粒数、单株穗数、千粒重、单株粒重、单株生物重等8个性状,综合参试材料3个不同环境的表现,通过变异系数及遗传多样性指数分析参试材料的遗传多样性,通过主成分分析、聚类分析等方法对参试六棱大麦种质进行了综合评价。结果表明:(1)六棱大麦的穗长、单株粒重2性状变异较丰富,株型性状与穗粒数变异系数较小,六棱大麦育种的增益效应主要体现在穗长和粒重的适度增加;(2)六棱皮大麦与六棱裸大麦仅在千粒重性状上差异显著,六棱皮大麦各性状多样性指数普遍高于六棱裸大麦;(3)参试六棱大麦种质分为5类,其中第5类为国内地方种质,分布广泛,但遗传距离较近;其他4类为国内外选育的种质,各具特性;(4)利用主成分二维排序分析筛选到以高产为基础,分别兼具矮秆、长穗且分蘖能力强、大粒及高生物重的4类优异种质;基于主成分构建了六棱大麦种质资源的综合评价方程。

    • 红花种质资源色价及主要产量性状的聚类分析

      2018, 19(5):857-864. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20171226003

      摘要 (1355) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2054) 评论 (0) 收藏

      摘要:以筛选出来的69份无刺红花资源为材料,利用相关性分析及聚类分析对其花瓣色价、单株果球数、单株果球种子数、果球直径、百粒重、单株种子产量、单株花瓣产量7个性状进行评估。结果表明:69份材料间存在较大的差异,对红花种子产量贡献最大的农艺性状是单株果球数;对红花花瓣色价进行分析,将69份红花资源分为3类,色价在6.3-14.1之间,其中色价极高型材料有14份,平均值达到12.38。对7个性状指标进行综合聚类分析,可以将69份红花资源分为5大类群,各类群性状变化丰富,其中组Ⅳ综合表现最好,是选育高色价、高产红花的优良材料。69份红花资源在色价和产量指标等方面表现出多样性,遗传较丰富,但色价高的资源材料相对较少。红花种质资源色价及主要产量性状的综合分析,可为红花资源的有效利用及选育高色价、高产红花新品种奠定基础。

    • 花生种质资源表型性状的综合评价及指标筛选

      2018, 19(5):865-874. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180105001

      摘要 (1586) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2604) 评论 (0) 收藏

      摘要:分析花生种质资源表型性状的遗传变异规律,构建花生种质资源的综合评价体系,筛选最优的评价指标。本研究以40份花生种质资源的17个表型性状为研究对象,利用变异系数与Shannon-Weaver多样性指数对表型性状的遗传多样性进行分析,采用聚类分析、主成分分析以及逐步回归分析对花生种质资源进行了综合评价和鉴定指标的筛选。结果表明:17个表型性状的变异系数变化范围为4.15%-31.82%,油酸、亚油酸以及蔗糖含量的性状变异丰富,出仁率、粗脂肪及蛋白质的性状较稳定。多样性指数变化范围为1.39-2.06,主茎高、百仁重及蛋白质的性状分布比较均匀,油酸、亚油酸及棕榈酸的性状分级及分布较不均匀。聚类分析把40份花生种质资源分为了4个类群。主成分分析把17个表型性状归为5个主成分(累计贡献率80.41%,反映出17个表型性状的大部分信息),依次为花生籽粒含油量因子、籽粒含糖量因子及丰产性因子,以上因子可以较准确的评价花生种质。花生种质表型性状的综合评价由F值大小判定,F值均值为0.73,开农176的F值最高,阜花12号的F值最低。由逐步回归分析筛选出8个表型性状:单株鲜果重、百果重、出仁率、粗脂肪、蛋白质、棕榈酸、油酸和蔗糖含量。花生种质资源遗传多样性较丰富,综合评价F值可以为花生种质资源评价提供参考,筛选的8个表型性状可以作为花生种质资源性状评价指标。

    • 花生籽仁外观和营养品质特征及食用花生育种利用分析

      2018, 19(5):875-886. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180110001

      摘要 (1655) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2457) 评论 (0) 收藏

      摘要:花生籽仁的外观品质和营养品质是评价食用花生品种的重要指标。本研究对285个不同类型或来源的花生种质资源进行了籽仁外观和营养品质性状的检测和分析,旨在为食用型花生品种选育提供依据。按照5个营养品质性状和籽仁的8个外观性状指标植物学类型可将285个品种分为2大组和6亚组,分析了各组类型的外观和营养品质性状分布规律及成因,结果表明该分类与品种的植物学类型和来源高度相关。,我国花生种质资源包含丰富的外观性状变异类型,能够满足不同加工用途对原料的需求,但总体上高油酸、高蛋白和低脂肪资源类型偏少。借鉴美国等烤制花生仁和糖果花生的外观和营养品质标准及我国煮食和烤制花生的生产消费市场,提出了食用型品种选育的亲本选择策略和备选品种类型,烤制和糖果用途花生育种亲本选配应以普通型或、中间型或珍珠豆型中粒农家品种或育成品种为骨干亲本,进一步改良高油酸、高蛋白和低脂肪等品质性状。

    • 135份国外藜麦种质主要农艺性状的遗传多样性分析

      2018, 19(5):887-894. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180209001

      摘要 (1669) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2042) 评论 (0) 收藏

      摘要:本研究对引自国外的135份藜麦种质资源的15个农艺性状进行了变异系数、遗传多样性指数、相关性分析、主成分分析和聚类分析。结果表明,该批藜麦种质具有丰富的遗传多样性。7个数量性状中,变异系数从大到小依次为:小区产量(57.83 %)> 单株粒重(57.37 %)> 茎粗(27.59 %)> 千粒重(22.50 %)> 株高(21.89 %)> 主花序长(19.38 %)> 生育期(13.89 %);8个质量性状遗传多样性指数从大到小依次为:主花序色(1.44)> 籽粒色(1.43)> 茎色(1.38)> 籽粒形状(0.88)> 幼苗新叶叶色(0.79)> 主花序形状(0.78)> 籽粒光泽(0.63)> 子叶颜色(0.08)。主成分分析结果表明,前5个主成分累计贡献率达到66.537%。第1主成分主要与株型、花序型和生育期有关;第2主成分主要与植株和花序颜色有关;第3主成分主要与产量有关;第4主成分主要与籽粒大小形状有关;第5主成分主要与籽粒颜色有关。通过表型评价鉴定,初步筛选出早熟、矮秆、粗秆、大粒、长花序、结实率好、产量高的特异种质31份。

    • 利用基于SSR标记的MCID法鉴定72个柿地方品种

      2018, 19(5):895-903. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20171226001

      摘要 (1561) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2082) 评论 (0) 收藏

      摘要:应用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID, Manual cultivar identification diagram)对来源于中国各地的72个柿地方品种进行了鉴定。结果表明,利用筛选出的6对引物进行PCR扩增、再统计凝胶电泳特征性谱带,最后人工绘制出品种树形鉴别图,可将72个柿地方品种在分子水平上进行快速区分。同时利用NTSYS-2.10e软件进行聚类分析,通过聚类分析树状图直观了解各品种间的遗传关系,在遗传相似性系数为0.62左右时,可以分为3个亚群。所得的MCID图比聚类树更具直观性与实用性,通过查阅MCID图可以快速获得鉴别这些地方品种所需要的引物以及依据的多态性谱带。这对柿种质资源的鉴定及促进柿产业的持续发展具有积极的意义。

    • 基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析

      2018, 19(5):904-911. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180123001

      摘要 (1430) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2254) 评论 (0) 收藏

      摘要:利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多态性条带165条,多态性比率为71.1%,平均每对引物扩增出8.68个条带,多态性信息含量变化范围在0.6706~0.9331,平均0.8158;其中引物SSR9和引物C33可将132份种质完全区分开,并构建供试材料的DNA指纹图谱,供试材料遗传距离在0.0363~0.5939之间,平均为0.4087,表明种质资源间遗传多样性丰富。基于SSR标记对供试材料进行聚类分析,将供试材料分为4亚类,第1类由济薯25与3份日本引进品种组成,第2类由济徐薯23、苏丹、济薯09281组成,第3类由37份S07材料和18份甘薯种质组成,第4类由剩余的70份种质组成,为甘薯分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。

    • 穗醋栗种质资源表型多样性分析及鲜食资源评价

      2018, 19(5):912-918. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20171222001

      摘要 (1396) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2097) 评论 (0) 收藏

      摘要:以国家果树种质寒地果树圃(公主岭)保存的黑穗醋栗资源为研究对象,计算分析22个表型性状多样性指数、标准差、变异度和极值,分析资源表型多样性,并以百果重、可溶性固形物、风味为指标,结合口尝鼻嗅评价,筛选适宜鲜食资源。结果表明,供试资源非数值型性状的Simpson指数和Shannon-weaver指数变化范围为0.13-0.74和0.46-2.10,数值型性状Simpson指数和Shannon-weaver指数变化范围为0.06-0.88和0.20-3.04,在供试资源的22个性状中,共有10个性状:初花期、花序着生状态、果皮厚度、果肉颜色、果实风味、果实质地、百果重、可溶性固形物、花序长度、每花序花数,多样性指数较高,表明现保存的黑穗醋栗资源表型多样性较为丰富,基本满足晚花、适宜果实鲜食与加工特性和(或)产量形成对表型多样性需求;果实整齐度、果实硬度多样性较差,因此需要加强相关资源收集评价研究。综合分析果实大小、风味、可溶性固形物等性状以及口尝鼻嗅评价分数,评价筛选出五份资源:11C-18(实生后代)、C82、11C-22(实生后代)、大粒甜、布劳德较适宜鲜食,可为进一步鲜食资源评价选育提供参考资源。

    • 不同光周期条件下谷子农艺性状的光周期敏感性评价

      2018, 19(5):919-924. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180207005

      摘要 (1511) HTML (0) PDF 0.00 Byte (1727) 评论 (0) 收藏

      摘要:本研究连续2年在海南和洛阳两个不同日照长度的生态区调查了156份谷子材料的株高、叶片数、抽穗期、穗长、穗粗、穗码数、码粒数、穗粒重、千粒重9个主要农艺性状,通过9个性状的相对光周期敏感度比较分析、构建光周期敏感性综合评价指标D值对各性状进行回归分析两种方法评价9个性状的光周期敏感性,筛选能够准确反映谷子光周期敏感性的指标性状,为开展谷子光周期敏感性遗传学分析、光周期敏感性相关基因的定位奠定基础。结果表明:光周期相对敏感度排列顺序为:穗码数>抽穗期>穗长>株高>叶片数>穗粒重;各个农艺性状对光周期敏感综合指标D的回归方程为D=-8.803×10-18 + 0.187X1 + 0.041X2 + 0.146X3 + 0.202X4 + 0.130X5 + 0.081X6 + 0.098X7 - 0.086X8 + 0.126X9,其中X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7、X8、X9分别代表抽穗期、穗粒重、株高、叶片数、穗长、穗粗、穗码数、码粒数、千粒重。9个农艺性状对光周期敏感综合指标D的直接作用最大的是穗码数(0.395),其次是穗长(0.239)、抽穗期(0.228)、穗粒重(0.176)、叶片数(0.164)、株高(0.144)。结合各个农艺性状的相对敏感度比较分析结果以及各农艺性状对综合指标D的回归分析结果,得出穗码数、穗长、抽穗期三个性状为谷子光周期极敏感指标,叶片数光周期敏感度较弱,可以作为谷子光周期敏感性评价的次要指标,株高、穗粒重在两种评价方法中排序差异较大,稳定性差,不适合作为谷子光周期敏感性评价指标。

    • 不同杂种优势群玉米茎秆纤维品质及配合力分析

      2018, 19(5):925-936. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180109002

      摘要 (1491) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2164) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究建立快速测定玉米茎秆纤维品质的近红外模型,用于评价不同杂种优势群的玉米材料的茎秆纤维品质。分析纤维品质性状的一般配合力,筛选纤维品质和配合力好的材料,为培育抗倒耐密玉米品种提供借鉴。本试验以玉米茎秆基部第3节间和第4节间为材料,利用近红外光谱漫反射光谱(NIRS)技术建立测定秸秆中纤维素、半纤维素和木质素的数学模型。基于建立的纤维品质模型对一年两点的94份自交系和376份杂交种的茎秆纤维品质进行预测和分析。对不同杂种优势群间整体差异进行方差分析,并评价其一般配合力效应。结果表明,各组分数学模型的校正决定系数、交叉验证和外部验证决定系数在0.801-0.998之间,各项误差在0.131-1.454之间,该模型准确性高,能较为准确预测玉米茎秆的纤维品质,为抗倒伏种质资源材料的鉴定提供参考。在各杂种优势群中,旅大红骨群的纤维品质最低,P群和唐四平头群纤维品质及其一般配合力正向效应较好。共筛选出了9个纤维品质好且一般配合力正向效应高的自交系。其中P群有2个,唐四平头群有1个,兰卡斯特群有2个,瑞德群2个,混合群2个。

    • 玉米卷叶突变体rol1的遗传分析与基因定位

      2018, 19(5):937-941. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180208001

      摘要 (1796) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2199) 评论 (0) 收藏

      摘要:叶型是作物理想株型育种的关键因素之一,发掘叶片发育相关基因对作物理想株型育种以及叶片发育的分子遗传机理研究具有重要意义。在玉米转座子Mutator活性系的杂交后代中,鉴定到一个玉米叶片卷曲的突变体,命名为rol1。突变体rol1在拔节期可明显观察到叶片内卷的表型,遗传分析表明,其卷叶性状受隐性单基因控制。以玉米自交系B73和rol1为双亲构建F2遗传定位群体,利用BSR-Seq技术,对F2分离群体中的卷叶表型单株和展叶表型单株分别取样混池,进行转录组测序,将rol1基因粗略地定位在玉米第5号染色体165-185 Mb区间内。进一步利用遗传分离群体中的卷叶表型单株缩小定位区间,将rol1基因定位在SSR 标记umc1822和 umc1155之间,物理距离为5 Mb。本研究为rol1 基因的克隆和功能研究奠定了基础。

    • 烟草黄绿叶突变体的遗传分析与基因定位

      2018, 19(5):942-950. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180131002

      摘要 (1406) HTML (0) PDF 0.00 Byte (1998) 评论 (0) 收藏

      摘要:以G117为父本,RG13为母本,杂交获得F<sub>1</sub>群体。系谱法常规选择过程中,在F<sub>3</sub>代株系内发现黄绿自然隐性突变株。该突变体的叶色在旺长期前呈现正常绿色,进入旺长期后,叶色逐渐发黄,叶脉呈乳白色,与正常烟株差别明显。遗传分析表明该突变体性状受一对隐性基因控制。从来源于一个连续自交单株的分离群体中分别选取10份隐性纯合烟株和10份显性烟株,利用430K烟草高密度SNP芯片进行基因型分析,快速确定了与目标性状相关联的标记。进而利用该分离群体验证相关分子标记,将该基因定位在烟草第5号染色体M7和M18之间,并与M7标记共分离。相关研究为进一步克隆该基因奠定了基础,同时也为烟草其他重要性状的定位提供了一种有效、快速的方法。

    • 小麦RING型E3泛素连接酶基因TaSDIR1-D克隆与功能分析

      2018, 19(5):951-958. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180309002

      摘要 (1652) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2031) 评论 (0) 收藏

      摘要:具有RING结构域的E3泛素连接酶SDIR1(SALT-AND DROUGHT INDUCED REALLY INTREASTING NEW GENE FINGER1)在植物信号调节通路中发挥着重要的作用。本研究克隆得到小麦TaSDIR1-D基因,基因组序列全长4070 bp,其中编码区上游为1443 bp,编码区为2352 bp,3′端非编码区(UTR)为275 bp,该基因编码区cDNA序列长度为849 bp,编码282个氨基酸,包括2个跨膜结构域和1个保守的RING型finger结构域。以野生近缘种的二倍体、四倍体和六倍体普通小麦及一套由中国春为背景的缺四体为材料,将基因定位在染色体4D上;小麦抽穗期TaSDIR1-D在旗叶中的表达量最高;在NaCl、ABA、PEG及4℃非生物胁迫诱导下,小麦TaSDIR1-D均上调表达,可能参与植物抗逆调节通路;通过检测32份多态性较高的小麦材料TaSDIR1-D基因序列多态性,共检测到2个SNP,基因的编码区和上游序列中各存在1个核苷酸变异,其中编码区的核苷酸变异位点(G/A)位于第4外显子上,为非同义突变,使精氨酸(CGC)变为组氨酸(CAC)。2个SNP组成两种单倍型,根据-583 bp处的SNP(T/C)设计分子标记SNP-583,扫描自然群体262份材料的基因型,将其分为2种单倍型,分别与千粒重、倒二节长和穗长显著相关或极显著相关,单倍型Hap-4D-2为提高千粒重的优异单倍型。研究结果为小麦分子育种提供了理论依据和基因资源。

    • 葡萄F-box基因VvSLY1的克隆与表达分析

      2018, 19(5):959-966. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180111001

      摘要 (1418) HTML (0) PDF 0.00 Byte (1906) 评论 (0) 收藏

      摘要:SLEEPY1(SLY1)属于F-box蛋白,是SCF复合体的主要组成原件之一,在赤霉素信号转导过程中发挥着重要的调节作用。本研究以‘夏黑’葡萄为试材,利用电子克隆和RT-PCR技术克隆获得一个F-box蛋白基因全长cDNA序列,命名为VvSLY1。该基因全长为1096 bp,包含1个555 bp的完整开放阅读框(ORF),编码184个氨基酸。序列比对和结构域分析结果表明,该VvSLY1包含F-box蛋白家族的LGG和LSL保守结构域。进化树分析结果显示,VvSLY1与胡杨亲缘关系最近。qRT-PCR分析结果表明,在果实快速膨大发育阶段,外源GA处理会促进该基因的上调表达。

    • 基于转录组测序的紫芽茶树花青素合成相关基因分析

      2018, 19(5):967-978. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180126001

      摘要 (1674) HTML (0) PDF 0.00 Byte (4392) 评论 (0) 收藏

      摘要:为筛选调控茶树芽叶紫色性状相关候选基因,以紫芽茶树品种‘紫娟’、绿芽茶树品种‘云抗10号’和‘福鼎大白茶’为材料,利用液质联用法(HPLC-MS)、转录组测序(RNA-Seq)和实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR),分析了紫芽和绿芽茶树品种芽叶花青素、儿茶素含量及合成相关基因的表达水平。结果表明,紫娟、云抗10号和福鼎大白茶芽叶花青素含量分别为5.05 mg/g、0.08 mg/g和0.15 mg/g,紫芽与绿芽茶树间花青素含量差异显著。3个茶树品种儿茶素含量分别为15.12 mg/g、19.52 mg/g和15.09 mg/g,差异不显著。转录组测序共获得255 079条转录本序列(Transcripts),组装出166 118条单基因簇(Unigenes)。所得单基因簇(Unigenes)注释为GO分类中54 446条,KOG分类中30 666条,KEGG分类中20 336条。DEG-Seq分析得到紫芽与绿芽茶树品种间共有434条差异表达基因,涉及到38个代谢通路。进一步筛选到类黄酮生物合成途径相关基因112条,有15条基因在紫芽与绿芽茶树品种间差异表达,其中PAL (Cluster-1850.70337)、CHS (Cluster-21971.0)、ANS (Cluster-1850.80848)和UFGT (Cluster-1850.77163)基因在紫芽茶树品种中上调表达,在绿芽茶树品种间表达差异不显著,表达趋势与花青素积累情况相似。FLS (Cluster-1850.81068)基因在绿芽茶树品种中均为上调表达,可能与儿茶素合成相关。qRT-PCR随机检测9个差异表达基因,表明不同茶树品种间差异表达基因的相对表达水平与转录组测序结果基本一致。因此,从基因表达模式推测,PAL、CHS、ANS和UFGT基因可能在紫芽茶树芽叶花青素生物合成途径中起关键作用。本研究探索了茶树芽叶紫色性状的转录组信息,筛选到一些差异表达基因,为进一步研究茶树芽叶呈色机制提供参考。

    • 核桃WD40转录因子JrATG18a基因的克隆及逆境响应

      2018, 19(5):979-986. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180121002

      摘要 (1561) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2433) 评论 (0) 收藏

      摘要:WD40转录因子在植物逆境响应中具有重要作用。本研究克隆获得核桃一条WD40家族的自噬相关蛋白(Autophagy-related protein)18a基因(JrATG18a),通过生物信息学和基因表达技术,分析不同非生物及植物激素处理下JrATG18a基因的表达规律,预测JrATG18a的基本生物功能。结果显示,JrATG18a的开放阅读框(ORF)为1371 bp,编码蛋白含456个氨基酸,分子量为50746.05 Da,理论等电点为5.97。与草莓、苹果、碧桃等具有较近的进化关系。其启动子含有热激响应(HSE)、低温胁迫(LTR)、水杨酸(SA)响应等相关元件。表达分析发现JrATG18a基因在热、寒、旱、SA、MeJA、ABA处理下能被不同程度的诱导,且体现出根和叶的表达差异。这些结果表明,JrATG18a基因能响应逆境参与核桃适应不良环境,可作为核桃抗逆分子育种的重要候选基因。

    • 华仁杏幼果转录组SSR信息分析及其分子标记开发

      2018, 19(5):987-992. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180222002

      摘要 (1460) HTML (0) PDF 0.00 Byte (2803) 评论 (0) 收藏

      摘要:为了解华仁杏微卫星(SSR)分布规律,开发EST-SSR引物,为华仁杏种质资源评价与辅助育种提供有效的鉴定标记。本研究采用生物信息学方法对华仁杏幼果转录组SSR位点的数量、频率、分布特征进行了统计分析;利用转录组数据进行了SSR引物的筛选和开发,并利用开发出的引物对华仁杏29个无性系进行了多态位点检测和鉴定。结果表明:华仁杏幼果EST-SSR的分布频率为19.21%,重复单元的重复次数分布在5~24次之间,优势重复基序为单核苷酸、2核苷酸、3核苷酸,分别占总SSR的19.81%,46.47%、32.49%。参试的139对引物中有39对引物可扩增出目标序列,其中24对引物可检测出多态性位点,占参试引物总数的17.27%。24对引物在29个华仁杏无性系中共检测出了170个等位基因位点,多态性信息含量(PIC)介于0.33~0.87之间,平均为0.64,其中高多态性引物19条,占多态性引物比例的79.2%。本研究对华仁杏转录组SSR信息进行了分析,并开发出了19对高多态性SSR引物,5对中多态性引物,为华仁杏种质资源评价及分子标记辅助育种提供了基础。

    • 马铃薯SRAP-PCR反应体系优化及验证

      2018, 19(5):993-1000. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180112002

      摘要 (1338) HTML (0) PDF 0.00 Byte (1782) 评论 (0) 收藏

      摘要:为建立马铃薯最佳的SRAP-PCR反应体系,以马铃薯基因组DNA为模板,采用单因素和正交试验相结合的方法,对影响SRAP-PCR反应体系的5个因素(引物浓度、Mg2+浓度、模板DNA用量、dNTPs浓度和 Taq DNA聚合酶用量)进行优化,建立马铃薯优化的SRAP-PCR反应体系。结果表明:马铃薯SRAP-PCR最佳反应体系中模板DNA用量为60 ng,Mg2+浓度为1.5 mmol/L,dNTPs浓度为0.25 mmol/L,引物浓度为0.60 μmol/L,Taq DNA聚合酶用量为0.75 U。各因素对扩增结果影响依次是:Mg2+浓度 > Taq DNA聚合酶用量 > 模板DNA用量 > 引物浓度 > dNTPs浓度。用6份马铃薯样品DNA对优化体系进行验证,扩增结果清晰稳定,可用于马铃薯遗传多样性分析和遗传图谱构建等研究。

    • >研究简报
    • 来源于疣粒野生稻的越冬性新种质SH5的鉴定

      2018, 19(5):1001-1005. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180107001

      摘要 (1038) HTML (0) PDF 0.00 Byte (1631) 评论 (0) 收藏

      摘要:低温冷害是影响水稻稳产的重要限制因子之一,鉴定和发掘利用优异的耐寒水稻种质资源是选育耐冷水稻品种以减少因低温对水稻生产不利影响的一条经济有效策略。本研究通过让正季种植的水稻植株自然越冬翌年观察是否长出再生苗的方式鉴定了一份来源于疣粒野生稻的越冬性水稻新种质SH5;0℃低温处理结果表明,SH5的越冬性与其地上部植株的耐寒性无关;田间越冬性观察表明,SH5以地表及其以下的茎越冬;SH5越冬再生苗的扦插种植具有与正季种植的SH5相近的农艺性状。越冬性水稻新种质SH5的鉴定,为选育生产上应用的耐冷水稻品种提供宝贵的新种质资源。

    • 中甸刺玫的系统位置及杂交起源研究

      2018, 19(5):1006-1015. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180109001

      摘要 (1324) HTML (0) PDF 0.00 Byte (1757) 评论 (0) 收藏

      摘要:中甸刺玫是云南特有的高山花卉和耐低温的月季种质资源,也是蔷薇属唯一有报道的10倍体野生种。然而,中甸刺玫的系统位置存在较大争议,其起源也不清楚。本研究利用5S rDNA和4个叶绿体DNA(cpDNA)片段(psbA-atpH、rbcL、rpl16和trnL-F)来构建蔷薇属的系统关系,明确中甸刺玫的系统位置;通过与近缘物种的序列比对,推测中甸刺玫的原始亲本。结果表明:①蔷薇属植物的5S rDNA序列长度为498bp-573 bp,变异程度随物种表现出明显差异。cpDNA片段中psbA-trnH变异较大,4个片段联合分析的矩阵长2969bp,其中变异位点170个。②分子系统树中,中甸刺玫均与桂味组的物种聚在一起,与小叶组的刺梨亲缘关系较远,其系统位置应从小叶组移至桂味组。③中甸刺玫的10倍体起源很复杂,其原始母本最可能是西南蔷薇,细梗蔷薇和华西蔷薇是其父本,而尾萼蔷薇和西北蔷薇也可能以父本的身份参与了中甸刺玫的杂交物种形成。

    • 少籽型白沙枇杷芽变资源“永路”的选育

      2018, 19(5):1016-1018. DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180423001

      摘要 (1173) HTML (0) PDF 0.00 Byte (1739) 评论 (0) 收藏

      摘要:“永路” 系浙江省地方品种软条白沙枇杷的芽变。经过作者15年多的连续选育和比较试验,该种质在形状、种籽、单果重、裂果率等决定遗传性状的关键因子方面与亲本形成显著差异,特别是在少籽、裂果方面性状显著超亲,结合前期分子标记等相关技术手段检测,明确为芽变资源。为此,该材料于2018年3月获得农业部国家植物新品种权授权。目前,该品种正在浙江省台州市等各地进行推广。

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